█ ► ↩ ملُِخـص آلُِوُحٍدِة آلُِثآنية ↪ ↞↞↞ العٍلُِآقٌة بَن آلُِبَنية وُآلُِوُظًيفُة ◄▌▒ ‏

〆 بٰٰاولو 乄 · 2017-07-04, 11:06

سلاااامو

ملاحظة

قبل مانبداو : جيبوا معاكم الكتاب ولي معندوش يشري

ولي معندوش مسكين زوالي ( gليل )

ها تفضل رابط تحميل الكتاب :

https://eddirasa.com/wp-*******/uplo...ce_sci_PDF.zip

كلمة سر الملف : eddirasa.com
بسم الله
نبداو على بركة الله

تمثيل البنية الفراغية للبروتين

تمثيل البنية الفراغية للجزيئات البسيطة:

يمكن تمثيلها بعدة نماذج أهمها:

* نموذج الكرة والعود (Bâtonnets et Boules) :

يهدف الى اظهار الذرات والروابط الموجودة فيما بينها.

* نموذج الكرة او المكدس (Sphères) :

إظهار حجم الجزيئة وتظهر الذرات فقط.

* نموذج العود ( Bâtonnets ) :

إظهار الروابط الكيميائية في الجزيئة.

* نموذج الخيط الحديدي ( fer de Fil ) :

يبين الروابط وتكون على شكل خيط رقيق.

نماذج مختلفة لتمثيل بنية حمض أميني: الوثيقة ( 1 )ص40.

تمثيل البنية الفراغية للجزيئات الكبيرة :

يمكن تمثيلها بنفس النماذج السابقة باإلضافة الى نماذج أخرى

تسمح بتوضيح جوانب أخرى من البنية الفراغية وهي:

* الشريطي(Rubans ) و الشريطي السميك ( Caricatures) :

يسمح بتوضيح البنيات الثانوية للجزيئة حيث تظهر البنيات

الحلزونية خ± على شكل شريط حلزوني وردي اللون، بينما البنيات

الوريقية خ² تظهر بشكل وريقات مطوية بلون أصفر، كما يسمح

بإظهار مناطق االنعطاف في شكل خيط سميك أبيض أو أزرق.

- نماذج مختلفة لتمثيل بنية بروتين: الوثيقة (2 ) ص41.

مميزات برنامج Rastop في دراسة البروتينات :

- عرض البنية الفراغية ثالثية األبعاد للجزيئات بنماذج مختلفة.

- دراسة البنية الثانوية بتحديد عددها ونوعها في البروتين.

- تحديد عدد السالسل الببتيدية المكونة للبروتين.

- تحديد عدد ونوع وتسلسل األحماض األمينية في البروتين.

- تحديد الجزء البروتيني والجزء غير البروتيني في الجزيئات.

- التعرف على الموقع الفعال للبروتين.

- التعرف على مختلف الروابط التي تساهم في ثبات البنية

( روابط هيدروجينية، جسور كبريتية..... )

مستويات البنية الفراغية لبروتينات :

- تتميز البنية الفراغية البروتينات بالتعقيد وتختلف درجته بين

البروتينات ويمكن وصف 4 مستويات بنيوية متدرجة التعقيد هي:

البنية الأولية :

- ارتباط أحماض أمينية بروابط ببتيدية لتكوين سلسلة ببتيدية

بدايتها NH2 ونهايتها COOH.

مميزات البنية األولية : الوثيقة (1 ) ص42

البنية الثانوية :

- هي التفاف البنية األولية في مناطق محددة في شكل بنيات

حلزونية خ± أو بنيات وريقية خ² وهذا بتشكل روابط هيدروجينية

بين NH وCO التابعة للروابط الببتيدية.

- مميزات البنية الثانوية: الوثيقة (2 )ص42.

البنية الثالثية:

- هي انطواء البنية الثانوية على مستوى مناطق االنعطاف لتأخذ

بنية فراغية محددة تحافظ على ثباتها بروابط مختلفة

(كبريتية،شاردية، هيدروجينية، تجاذب الجذور الكارهة للماء).

- مميزات البنية الثالثية: الوثيقة ( 3 )ص43

البنية الرابعية :

-هي ارتباط سلسلتين ببتيديتين أوأكثر بروابط ضعيفة تحافظ على

استقرارها لكل منها بنية ثالثية وتسمى كل واحدة "تحت الوحدة"

- مميزات البنية الرابعية: الوثيقة (4 ) ص44

العلاقة بين بنية ووظيفة البروتين :

- إن اختالف البنية الفراغية للبروتينات يعود الى اختالف عدد

ونوع وترتيب األحماض األمينية الداخلة في تركيبها.

تعريف الأحماض الأمينية :

- هي جزيئات بسيطة تمثل الوحدة البنائية األساسية للبروتينات،

وهي مركبات عضوية مقسمة الى جزأين:

* جزء ثابت:

يتكون من وظيفة أمينية (NH2 )

ووظيف ةكربوكسيلية (COOH ) متصلتين بذرة كربون مركزية (Cخ± )

التي تتصل أيضا مع (H )

وهو موجود عند جميع الأحماض الأمينية

* جزء متغير:

يتمثل في سلسلة جانبية أو جذر ألكيلي يرمز له

(R) ويختلف تركيبه من حمض أميني الأخر

تصنيف الأحماض الأمينية :

يمكن تصنيفها حسب الجزء المتغير ( الجذر R )إلى 3 أصناف:

* أحماض أمينية حامضية:

يحتوي الجذر على مجموعة حمضية (COOH )عددها 2 هي:

غلوتاميك (Glu ) وأسبارتيك (Asp)

* أحماض أمينية قاعدية :

يحتوي الجذر على مجموعة أمينية(NH2 )عددها 3 وهي:

ليزين(Lys ) أرجينين (Arg) هيستدين (His)

* أحماض أمينية متعادلة:

تمتاز بعدم وجود مجموعة حمضية أو قاعدية في الجذر R

وعددها 15 يمكن تقسيمها حسب نوع الوظائف الموجودة في

جذورها الى:

كحولية، عطرية، كبريتية، أليفاتية، أميدية، حلقية.

تشكل الرابطة الببتيدية بين الأحماض الأمينية :

هي رابطة تكافؤية قوية تتشكل بين المجموعة الكربوكسيلية

للحمض األميني األول والمجموعة األمينية للحمض األميني

الموالي مع انطالق جزيء من الماء.

سلوك الأحماض الأمينية في الوسط :

- يتغير سلوك الحمض األميني بتغير درجة pH الوسط، وهجرته

في المجال الكهربائي تعتمد على نوع الشحنة التي يكتسبها.

- تسلك األحماض األمينية سلوك األحماض( تفقد بروتونات)

في الوسط القاعدي وتسلك سلوك القواعد ( تكتسب بروتونات)

في الوسط الحامضي لذلك تسمى بالمركبات الأمفوتيرية (الحمقلية)

القاعدة التي تسمح بتحديد شحنة الحمض األميني:

-تعريف نقطة التعادل الكهربائي (PHi)

هي قيمة يكون عندها الحمض األميني متعادل كهربائيا، عدد

الشحنات الموجبة والسالبة متساوي أي شحنة معدومة (0)

- PH=PHi شحنة الحمض األميني معدومة (0) :

- ال يهاجر الى أي قطب ( يبقى في المنتصف ) ويدل على تساوي

الشحنات (+) و(-) أي تأين الوظيفة األمينية

( +NH3 ) والحمضية

( - COO ) ومنه يسلك سلوك حمض وقاعدة في نفس الوقت

- PH>PHi شحنة الحمض األميني موجبة (+) :

- يهاجر الى القطب (-) ويدل على اكتسابه بروتون
(+H ) من الوسط

وتأين الوظيفة الأمينية ومنه يسلك سلوك قاعدة في وسط حامضي

- PH<PHi شحنة الحمض األميني سالبة (-) :

- يهاجر الى القطب (+) ويدل على فقدانه بروتون
(+H ) من الوسط

وتأين الوظيفة الحمضية ومنه يسلك سلوك حمض في وسط قاعدي

- القاعدة التي تحدد قيمة PHi التقريبية لألحماض األمينية :

* الأحماض الأمينية المتعادلة : لها PHi قريب من المعتدل.

* الأحماض الأمينية الحامضية : لها PHi أقل من المعتدل.

* الأحماض الأمينية القاعدية : لها PHi أكبر من المعتدل.

دوك نحطلكم الصيغة العامة للأحماض الأمينية و كيفية تشكيل الرابطة البيبتيدية

على شكل صور باه تفهموا بياا

يتبع ....