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Voila le programme de cour de magister djelfa
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2011-10-02, 13:09 | رقم المشاركة : 1 | ||||
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Voila le programme de cour de magister djelfa
I1. GENIE GENETIQUE
1. Enzymes utilisées en Biologie moléculaire - Nomenclature - Mode d’action 2. Mutagénèse : aspects appliqués - Mutagénèse classique - Mutagénèse dirigée 3. Recombinaison in-vitro, clonage et manipulation génétique - Différentes sources possibles et préparation de l’ADN à cloner - Différents types de vecteurs et leur particularité - Stratégies de recombinaison de l’ADN à cloner avec l’ADN vecteur - Les cellules hôtes et les différents modes de transfert de l’ADN - Construction de banques - ADN génomique - ADN complémentaire (ADNc) - Sélection et criblage des clones recombinants - Méthodes d’analyse du gène purifié - hybridation - restriction et séquençage - Expression des gènes clonés - Applications, perspectives et limites du clonage
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2011-10-02, 13:10 | رقم المشاركة : 2 | |||
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biochimie
BIOCHIMIE |
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2011-10-02, 13:11 | رقم المشاركة : 3 | |||
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Microbiologie generale+microbiologie alimentaire
MICROBIOLOGIE ALIMENTAIRE
I. INTRODUCTION : Rappels sur la classification des micro-organismes - Les unités de la classification biologique - Notion de l’espèce bactérienne - Notion de clone, biotype - Les différents types de classification II. LES GRANDS GROUPES MICROBIENS INTERESSANT LA MICROBIOLOGIE ALIMENTAIRE 1. Les ferments lactiques - Définition et métabolisme fermentaire - Propriétés générales et habitats - Classification et étude de quelques genres - genre : Strepotococcus - genre : Leuconostoc - genre : Lactobacillus - genre : Lactococcus - Rôle et importance pratique (acidification, activité protéolytique, production d’arômes, de viscosité, de gaz, de dextranes, dosages microbiologiques,...) 2. Les entérobactéries - Caractères généraux du groupe - Classification et techniques d’identification - Etude de quelques genres - genre : Escherichia - genre : Klebsiella - genre : Salmonella - genre : Shigella - genre : Proteus 3. Les bactéries sporulées (caractères généraux, siolement, identification) - Les bactéries sporulées aérobies: étude du genre Bacillus - Les bactéries sporulées anaérobies: étude du genre « clostridium » 4. Les microcoques (classification, caractères généraux, siolement, identification et étude du genre Staphylococcus) 5. Autres bactéries (classification, caractères généraux, siolement, identification, intérêt) - Les bactéries saprophytes (genre: Pseudimonas et Acetobacter) - Les bifidobactéries - Les vibrions - Les actinobactéries - Les brucelles 6. Les levures - Caractères généraux - Classification - Rôles dans l’alimentation (utiles et nuisibles) 7. Les moisissures - caractères généraux - Classification - Rôles dans l’alimentation (utiles et nuisibles) III. LES ALT2RATIONS MICROBIENNES DES ALIMENTS ET LES MOYENS DE LUTTE 1. Les divers aspects de la bactériologie alimentaire 2. Les facteurs influençant la flore d’altération des aliments - Les facteurs du milieu (pH,potentiel d’oxydo-réduction, Aw, température, état des nutriments en présence, effect des sels, effet du sucre,...) - Les facteurs induits par l’effet de traitements physiques et physico-chimiques 3. Les moyens de lutte - Les moyens physiques - inhibition à basse température * effets de la réfrigération * effets de la congélation * problèmes posés par les germes psychrophiles - destruction thermique * effets des traitements de thermisation, blanchiment, pasteurisation et stérillisation sur les micro-organismes * problèmes posés par les germes sporulés - effets des pressions partielles en O2 ,N2 et CO2 sur la prolifération des micro-organismes - effets de la bactofugation et de la filtration - effets des radiations - Les moyens chimiques et biologiques - acidification du milieu - addition du sel (cas des germes halotolérants) - addition d’antiseptiques - addition d’antibiotiques - autres moyens IV. CATEGORIES D’ALIMENTS ET ACTIVITES MICROBIENNES 1. Les sucres et les produits riches en sucres 2. Les céréales et ses dérivés 3. Les légumes et les fruits frais 4. Les laits et les produits laitiers 5. Les viandes et les produits carnés |
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2011-10-02, 13:12 | رقم المشاركة : 4 | |||
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MICROBIOLOGIE GENERALE
CHAPITRE I. Le monde microbien 1. Historique 2. Place des microorganismes dans le monde vivant 3. Caractéristiques générales de la cellule procaryote CHAPITRE II. La cellule bactérienne 1. Techniques d'observation de la cellule 2. Morphologie cellulaire 3. La paroi 3.1. Composition chimique 3.2. Structure moléculaire 3.3. Fonctions 3.4. Coloration de Gram 4. La membrane cytoplasmique 4.1. Composition chimique 4.2. Structure 4.3. Fonctions 5. Le cytoplasme 5.1. Ribosomes 5.2. Substances de réserve 6. Le chromosome 6.1. Morphologie 6.2. Composition chimique 6.3. Structure 6.4. Réplication 7. Les plasmides 7.1. Structure 7.2. Réplication 7.3. Propriétés 8. Capsule 8.1. Morphologie 8.2. Composition chimique 8.3. Fonctions 9. Les cils et flagelles 9.1. Mise en évidence 9.2. Structure 9.3. Fonctions 10. Spore 10.1. Morphologie 10.2. Structure 10.3. Phénomène de sporulation 10.4. Propriétés 10.5. Germination 11. Bactéries intracellulaires 11.1. Chlamydies 11.2. Rickettsies CHAPITRE III. Classification Bactérienne CHAPITRE IV. Nutrition Bactérienne 1. Besoins élémentaires 2. Facteurs de croissance 3. Facteurs physiques CHAPITRE V. Croissance Bactérienne 1. Mesure de la croissance 2. Paramètres de croissance 3. Courbes de croissance 4. Culture des bactéries CHAPITRE VI. ****bolisme microbien 1. Enzymes 2. Types respiratoires 3. Métabolisme des glucides 4. Métabolisme des lipides 5. Métabolisme des protéines CHAPITRE VII. Les agents antimicrobiens 1. Définitions 2. Action antimicrobienne 3. Agents antimicrobiens physiques 4. Agents antimicrobiens chimiques 5. Agents chimiothérapeutiques CHAPITRE VIII. Introduction à la mycologie : Les levures 1. Classification 2. Morphologie cellulaire 3. Méthodes d'isolement 4. Méthodes d'identification 5. Reproduction CHAPITRE IX Les virus 1. Morphologie des virus 1.1. La capside 1.1.1. Symétrie cubique 1.1.2. Symétrie hélicoïdale 1.2. Les enveloppes 2. Virus spécifiques des Eucaryotes 2.1. Virus à ARN 2.2. Virus à ADN 3. Virus spécifiques des procaryotes 4. Résistance des cellules aux virus CHAPITRE X Rôles des microorganismes dans l'industrie 1. Rôle utile 2. Rôle néfaste |
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2011-10-02, 13:17 | رقم المشاركة : 5 | |||
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هذا ملخص زين نتاع ميكروبيولوجي جنيرال https://www.fsr.ac.ma/cours/biologie/...%20-%20SVI.pdf آخر تعديل أم أشـرف 2014-06-08 في 18:23.
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2011-10-02, 13:36 | رقم المشاركة : 6 | |||
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شكرا اخي الكريم ربي يجزيك خير ويعطيك ماتتمنى |
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2011-10-02, 14:04 | رقم المشاركة : 7 | |||
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آخر تعديل أم أشـرف 2014-06-08 في 18:24.
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2011-10-02, 14:19 | رقم المشاركة : 8 | |||
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LES GRANDS GROUPES MICROBIENS INTERESSANT LA MICROBIOLOGIE ALIMENTAIRE 1. Les ferments lactiques
Les bactéries lactiques Les bactéries lactiques sont des micro-organismes utiles à l'homme lui permettant de fabriquer et de conserver un nombre important de ses aliments. elles sont surtout connues pour le rôle qu’elles jouent dans la préparation des laitages fermentés, elles sont utilisées également dans le saumurage des légumes, la boulangerie, la fabrication du vin, le saurissage des poissons, des viandes et des salaisons(EUFIC,1999). Elles sont devenues les principaux candidats probiotiques et bénéficient d’un statut GRAS (Generally Regarded As Safe) (Ait Belghanaoui, 2006). 2-Définition Les bactéries lactiques regroupent un ensemble d'espèces hétérogènes (Labiouiet al.,2005). Ce sont des cellules vivantes, autonomes et procaryotes (Doleyres, 2002), dont le trait commun est leur aptitude à produire de l’acide lactique suite à la fermentation des glucides(Ait Belghanaoui, 2006). Cette transformation génère de une ou deux molécules d’ATP, en fonction de la voie métabolique homo ou hétérolactique (Raimbiault, 2005) _ Voie d'Embden-Meyerhof : homofermentation, dont laquelle l'acide lactique est le principale ou le seul produit du métabolisme excrété à partir du substrat (Larpent-Gourgaud et al., 1997). _ Voie de Dickens-Horecker : hétérofermentation, conduisant à l’acide lactique en mélange avec d’autres produits d’excrétion comme le CO2, acide acétique, éthanol,…selon les microbes considérés(Bourgeois et Bouix, 1980). 3- Caractères généraux des bactéries lactiques Les bactéries lactiques sont des cocci ou des batonnets (Larpent, 1989) elles sont en générale aérotolérantes. Cependant certaines espèces habitant par exemple le tube digestif des animaux sont anaerobies strictes, même en présence d'O2, elles sont incapables de réaliser la phosphorylation oxydative. Elles sont Gram-positif; généralement immobiles et asporulées (Delaglio et al., 1994). Elles ne possèdent ni catalase, ni nitrate réductase, ni Cytochrome oxydase. En plus de cela ne liquéfient pas la gélatine, ne produisent pas d'indole ni d'hydrogène sulfureux(Delaglio et al., 1994) 4- Habitat Les bactéries lactiques sont ubiquistes et on les trouve dans différentes niches écologiques comme le lait et les produits laitiers, les végétaux, la viande, le poisson, les muqueuses humaines et animales et dans le tractus digestif (Douault et Corthier, 2000)et ont été également retrouvées dans le sol, les engrais, et les eaux d’égout (Holzapfel et al., 1996. Cité par Givry, 2006). 5- Taxonomie des bactéries lactiques La taxonomie des bactéries lactiques a été basée sur la coloration de Gram et il est possible de les classer suivant la nature des produits du métabolisme bactérien obtenus à partir des glucides (Givry, 2006). Les bactéries lactiques regroupent 11 genres dont les plus étudiés sont Lactobacillus, Lactococcus, Streptococcus, Leuconostoc, Oenococcus Enterococcus et pediococcus (Stiles et Holzapfel, 1997. Cité par Givry, 2006) 5.1- Le genre streptococcus Ces bactéries sont des cocci sphériques ou ovoïdes regroupées en paires ou en chaînettes, en générale immobiles, à partir des glucides leur métabolisme est homofermentaire, elles produisent un certain nombre d'agents antimicrobiens (Larpent, 1990). 5.2- Le genre lactobacillus Le genre Lactobacillus est quantitativement le plus important des genres du groupe des bactéries lactiques (Euzeby, 2004), leur morphologie microscopique varie d'une espèce à l'autre de coccobacilles aux bacilles fines et allongés (Euzeby, 2000) On rencontre des Lactobacillus dans la flore intestinale et la flore vaginale (Jofin, 2004). Selon (Pilet et al., 1996) Le genre lactobacillus se subdivise en trois groupes: ·Groupe 1 :Thermobacterium ·Groupe 2 :Streptobacterium ·Groupe 3 :Betabacterium |
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2011-10-02, 14:19 | رقم المشاركة : 9 | |||
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en fiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiin |
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2011-10-02, 14:21 | رقم المشاركة : 10 | |||
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suit
5.3 - Le genre lactococcus
Ce sont les streptocoques mésophiles (Hallem, 1991).Ils se présentent sous forme de coques, qu'on trouve isolés, en paires ou en chaînettes de longueur variable (Desmazaud, 1996), ce sont des organismes homofermentaires ne produisant que de l'acide lactique L (+) (Delaglio, 1994). 5.4- Le genre leuconostoc Les cellules de leuconostoc sont des coques disposées en paires ou en chaînes comme les streptocoques mais cette bactérie est hétérofermentaire produisant de l'acide D (-) lactique, de l'éthanol et du CO2, ses espèces sont caractérisées par la production à partir du citrate du lait, de diacetyl, parfois du citrate, et de dextranes et de levanes en présence de saccharose (Novel, 1993). 5.5- Le genre pediococcus Les pediocoques sont des germes microaerophiles à besoins nutritifs complexe, leur fermentation homolactique donne parfois l'acide lactique racémique, mais fréquemment la forme L prédomine (Guiraud, 1998). 6- Les exigences nutritionnelles des bactéries lactiques Si les bactéries lactiques sont considérées comme un des groupes bactériens les plus exigeants du point de vue nutritionnelle, c’est parce qu’elles requièrent non seulement des substrats complexes carbonés, azotés, phosphatés et soufrés, mais aussi des facteurs de croissance comme les vitamines et les oligo-éléments dont le rôle de cœnzyme a été déjà développé (Luquet ,1986). 6.1- Les glucides Pour croître, les bactéries lactiques ont besoin d'un apport de nutriments comportant au moins un sucre fermentescible comme source d'énergie. La fermentation des sucres s'effectue essentiellement en trois étapes. Premièrement, le transport du sucre à travers la barrière hydrophobe de la membrane cellulaire. Deuxièmement, le catabolisme intracellulaire du sucre et enfin la formation et I'expulsion extracellulaire des métabolites terminaux généralement acides (Monnet et Gripon, 1994). Deux types de métabolismes fermentaires sont rencontrés. Un métabolisme aboutit de façon quasi-exclusive à la production d’acide lactique (caractère homofermentaire). L’autre peut produire de l’acide lactique, mais également de l’éthanol et de l’acide acétique suivant les conditions de cultures (caractère hétérofermentaire) (Renouf, 2006) 6.2- L'azote Les bactéries lactiques exigent aussi l'apport exogène d'acides aminés pour leur croissance car elles sont incapables, pour la plupart, d'en effectuer la synthèse à partir d'une source azotée plus simple (Desmazaud, 1983). Elles ne peuvent absorber et utiliser que des acides aminés libres, ou des peptides courts (peptidases, dipeptidases). Leur nutrition azotée exige donc l'hydrolyse des grandes protéines du lait, et notamment les caséines, par des enzymes (les protéases) situées dans la paroi extérieure de la cellule (Desmazaud, 1998). 6.3- Les vitamines Les vitamines jouent dans le métabolisme cellulaire le rôle irremplaçable de coenzyme. Les bactéries lactiques sont, à quelques exceptions près, incapables de synthétiser des vitamines (Desmazaud et De Roissart, 1994), d'où l'importance d'un apport exogène de vitamines au milieu de culture (Cocaign-Bousquet et al., 1995). 6.4- Les minéraux La nécessité des ions dans le métabolisme s'explique d'abord par leur fonction de cofacteur pour de nombreuses enzymes (Novel, 1993). Du point de vue transport, le fer est un élément important puisqu'il a des affinités pour un grand nombre de molécules chelatrices. Il augmente la croissance et la production d'acide lactique pour les lactocoques et une carence en cet élément donne lieu à une diminution de ce même acide (Boyaval, 1989). Le potassium, quant à lui, est un cofacteur pour plusieurs enzymes bactériennes et un niveau élevé de K+ dans le cytoplasme est requis pour la synthèse protéique. De plus, le système du K apparaît être très important pour contrôler le pH cytoplasmique (Desmazaud, 1983). 6.5- L'oxygène Les bactéries lactiques sont communément appelées microaerophiles. Ainsi, elles tolèrent de petites quantités d'oxygène, mais de trop grandes teneurs en ce gaz peuvent leur être néfaste. La relation des bactéries lactiques avec l'oxygène a probablement un lien avec le peroxyde d'hydrogène (H2O2) produit dans la cellule en présence d'air. Il faut éliminer le H2O2, car son accumulation devient toxique (Vignola, 2002). 7- Rôle des bactéries lactiques 7.1- Rôles technologiques 7.1.1- Production d'aromes Certaines bactéries lactiques sont capables de produire des composés d’arômes qui participent aux qualités organoleptiques des fromages. La plupart des composés d’arôme sont issus du métabolisme du citrate : l’acétoïne et le diacétyle sont les plus importants (Aubert, 1998). 7.1.2- Production d'exopolysaccharides Certaines souches de bactéries lactiques ont la capacité de synthétiser et d'excréter, au cours de leur croissance, des polymères de sucre appelés polysaccharides exocellulaires ou EPS, qui permettent d'améliorer la texture et la viscosité du produit fini (Dupont, 1998). En général, la présence de polysaccharides dans des produits fermentés, tels les yogourts, permet d'augmenter l'homogénéité du produit et rend sa présentation plus agréable (Desmazaud, 1983). 7.2- Rôle dans la conservation Les bactéries lactiques jouent un rôle essentielle dans la conservation des produits alimentaires (Bousmaha et al., 2005), elles sont capables de produire une variétés de produits inhibiteurs dont les effets peuvent se répercuter sur la flore lactique elle-même mais aussi sur la flore indésirable ou pathogène (Piard et Desmazaud, 1991). 7.2.1- Production d'acides et diminution de pH Les acides organiques sont produits par les bactéries lactiques lors du processus de fermentation et permettent d’inhiber la croissance des levures et d’autres bactéries qui ne peuvent se développer à pH acide. L’effet inhibiteur de ces acides organiques est principalement provoqué par les molécules non dissociées qui diffusent à travers les couches lipidiques des membranes des microorganismes provoquant ainsi un abaissement du pH dans le cytoplasme qui a pour conséquence la déstabilisation des cellules (Brillet, 2005). 7.2.2- Production de peroxyde d'hydrogène La production et l'accumulation de peroxyde d'hydrogène crée un environnement toxique pour les cellules non équipées de système de protection capable de dégrader ce composé. Son accumulation est inhibitrice vis-à-vis des souches qui génèrent de peroxyde mais aussi vis-à-vis d'autres microorganismes (De Roissart et Luquet, 1994). 7.2.3- Production de bactériocines Les bactériocines sont des substances de nature protéique synthétisées par des bactéries et qui ont un pouvoir antibactérien dirigé contre des bactéries taxonomiquement proches du micro- organisme producteur (Daoudi, 2000). Ces peptides antibactériens ont une action contre les bactéries à Gram positif associées à l’altération de la qualité hygiénique des aliments et à certaines pathologies humaines (Ennahar, 2007). D'autres agents antimicrobiens sont ainsi produites : dioxyde de carbone (CO2), l’acide acétique, le Diacétyle et l’acétaldéhyde (Drider, 2004) 8- Les bactéries lactiques et leur action probiotique Le terme probiotique dérive de deux mots grecs « pro » et « bios » et signifie littéralement « en faveur de la vie » (Roberfroid, 2002). Un probiotique est un microorganisme vivant qui est lorsqu’il est ingéré en quantité suffisante il exerce un effet positif sur la santé (Dacosta, 2001). Les bactéries lactiques sont de plus en plus utilisées en alimentation humaine et animale pour leurs effets probiotiques (Givry, 1996). Parmi ces effets on peut citer : ·Les bactéries lactiques exercent un effet inhibiteur sur le développement et la synthèse de toxines par autres microorganismes pathogènes (Karovicova et Kohajdova, 2003) ; ·Les bactéries lactiques possèdent des propriétés antitumorales qui pourraient être due à: oL'inactivation ou l'inhibition des composés carcinogènes dans le tractus gastro-intestinal. oLa réduction des activités enzymatiques des bactéries intestinales telle que la β.glucoronidase, l'azoréductase et la nitroréductase (Chafai ,2006). ·La prévention et traitement des diarrhées dues aux infections gastro-intestinales (Lyons, 2000) ; ·Certaines souches de bactéries lactiques ont la capacité de déconjuguer les sels biliaires : les formes déconjuguées ont un pouvoir inhibiteur plus important sur le développement des bactéries que les formes conjuguées ; ·Certaines souches de probiotiques notamment les lactobacilli excrètent la β.galactosidase souvent déficiente dans le tractus digestif de l'hôte et facilitent la digestion du lactose, elles stimuleraient l'activité enzymatique des microorganismes endogènes, permettant ainsi une meilleure assimilation des aliments. Elles stimuleraient également les activités lactase et invertase des cellules épithéliales du tractus digestif (Larpent et Larpent-Gourgaud, 1997) ; ·La diminution de la cholestérolémie par réduction de l’absorption intestinale du cholestérol endogène et exogène et la diminution de sa synthèse dans le foie (Roberfroid, 2002 |
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2011-10-02, 14:31 | رقم المشاركة : 11 | |||
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voilal liver https://www.anancy.net/documents/file...on_qualite.pdf آخر تعديل أم أشـرف 2014-06-08 في 18:25.
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2011-10-02, 14:49 | رقم المشاركة : 12 | |||
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ايا لي عتدو مايحسدش يلله نشطو الحالة |
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2011-10-02, 15:30 | رقم المشاركة : 13 | |||
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pour telecharger |
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2011-10-03, 14:08 | رقم المشاركة : 14 | |||
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ginie gintique
[IMG]https://www.lekraya.com/attachments/Image/aidememoire_biologie_et_genetique_moleculaire.jpg[/IMG] |
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2011-10-03, 14:21 | رقم المشاركة : 15 | |||
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السلام عليكم
السلام عليكم بارك الله فيك أخي و جزاك الله كل خير ان شاء الله |
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cour, djelfa, magister, programme, voila |
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